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全国中西医结合胆胰疾病诊疗中心 是经国家中医药管理局批准的重点建设学科，该中心学科带头人是中国工程院院士吴咸中教授，学术带头人是崔乃强教授、秦鸣放教授。设临床部及基础部，临床部由第二外科，第三外科，消化内镜诊疗中心，超声诊断中心组成。中西医结合治疗胆囊结石，胆总管结石，急性重症胆管炎及急性重症胰腺炎，取得显著疗效，居全国领先水平。胆胰中心承担天津市及全国胆胰疾病患者的会诊任务。
消化内镜诊疗中心 是具有全国影响的腔镜外科基地，引进日本欧林巴斯电子内镜设备及日本东芝公司X光机，除了开展各种胃肠及胆胰疾病的内镜诊断外，广泛开展了内镜治疗，并以经十二指肠镜对胆胰疾病诊疗为重点，通过ERCP诊断胆胰疾病已一万余例，经内镜治疗各种胆胰疾病近三千例，诊疗成功率均达到98%以上，在国内居领先水平。内镜诊疗适用于：肝内外胆管结石、胆管狭窄（良、恶性）等胆道疾病及胰腺疾病；食道静脉曲张、狭窄；胃、结肠息肉、出血及异物的诊治等消化系统疾病。
中西医结合胃肠疾病诊疗基地：被天津市卫生局确定为以中西医结合、内外科联合为特征的治疗胃肠疾病的专科基地，以中西医结合为理论基础，医、理、药全面发展为目标，技术水平居全市先进。
超声诊断中心 该中心是天津市第一家腹部超声诊断单位。开展了多项新的B超影像学技术，如：对梗阻性黄疸的鉴别诊断，胆道系统结石的诊断及治疗前后的观测，急慢性胰腺炎的诊断及中西医结合治疗中的B超动态监测，胃及十二指肠溃疡病穿孔的B超诊断，各类型急性阑尾炎的B超诊断，胃肠道肿瘤、炎症及肝、胆胰、脾等腹腔内位性病变的B超检查，正确率达95%以上，居国内领先水平。
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