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肝内胆管结石的治疗以外科手术为主要手段。其治疗原则是解除病灶、祛除病因、建立通畅胆道引流。术中探查肝内胆管，取出结石。多发结石位于二级以上胆管，难以用常规方法取出时，可借助术中胆道镜网篮取石；对于较大结石则可采用术中激光碎石方法将结石击碎，再分别取出；对于存在肝内胆管节段性狭窄并肝叶或段萎缩者，也可行肝叶或肝段切除。最常施行的肝叶切除是左肝外叶或左半肝切除。右肝某段萎缩后也可行肝段切除。对于主要肝胆管如肝门部胆管狭窄者，可行胆管整形，胆管空肠R-Y吻合术。对于一次难于取净结石者可留置术后胆道镜取石通道，待术后6-8周后经窦道胆道镜取石。
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