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深圳市非典型肺炎疫情一直受到比较有效的控制，没有发生群体性疫情。这个市正进一步加强防治措施，以从根本上控制疫情扩散。
据深圳卫生部门介绍，从4月1日至9日，深圳共确诊11个病例。自发现“非典”病例至今，全市共确诊病例累计达到39例。到目前为止，病愈出院共21例，现有住院病例为13例，在深圳死亡1例(住院时已病重)，转外地治疗4例。由于预防措施到位，深圳没有发生群体性疫情，但仍然有零星病例出现。
目前，深圳正采取“预防为主、防治结合”的方针，全面加强疫情的监测，完善相关的应急预案，进一步控制疫情的蔓延。社区、学校、医院、公交车辆等都进行了彻底的环境消毒，特别是学校、幼儿园基本做到天天通风、夜夜消毒，并配备了必要的消毒设备和预防药物。同时，深圳还积极开展防治“非典”的健康教育活动，通过各种方式宣传防病健身知识，这些措施，对“非典”的防治起到了积极作用。
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