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由于非典型肺炎有较强的传染性，可通过近距离空气飞沫、病人分泌物传播，卫生部日前提出，要综合做好预防院内感染发生的各项措施，医务人员要增强体质，注意劳逸结合，避免过度劳累，提高抵抗疾病的能力。
具体的防护措施如下：
医护办公室通风换气，保持室内空气流通。
医护人员进入病区必须戴12层棉纱口罩，4小时应更换；进入病房均需穿隔离衣、戴手套、工作帽和鞋套。
医护人员在每次接触病人后立即进行手的消毒和清洗。手消毒可用0.3%至0.5%碘伏消毒液浸泡或擦拭手部1至3分钟，洗手应采用非接触式的洗手装置。
进行近距离操作时，除做好上述防护外，应戴防护眼镜。
医护人员在进入、离开病区时，要注意呼吸道及粘膜防护。
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